浸种时采用袋装（井底布网状袋）浸种，浸种袋不要装得太满，大半袋即可，整齐的码放在浸种箱内（距箱边10～15厘米），加入清水没过种子15～20厘米即可。浸种温度11～12℃，时间9～10天，浸种积温100℃以上。集中浸种时浸种液每天要进行1～2次循环，调温增氧；如果常规浸种装置袋装浸种时，可以上下翻动浸种袋，但要轻拿轻放，不允许散放浸种。要随时检测浸种箱内温度变化，一旦温度超过指标，立即以循环水降温、打开遮阳网或通风降温。浸好种子颖壳表面颜色变深，种皮呈半透明状态，透过颖壳可以看到腹白和种胚，剥去颖壳米粒易掐断，手捻米粒成粉末，没有生芯。浸好种子捞出后即可直接催芽。

浸种的同时要进行药剂消毒。消毒是为了防除种子传播的恶苗病、苗稻瘟病等病害，对后期的稻瘟病无效。除使用种衣剂以外，常规消毒所用药剂：25%施保克25毫升+0.15天然芸苔素20毫升，浸100公斤种子，加120公斤水。

    浸种要正确掌握浸种水的用量和浸种时间。浸种的水必须没过种子，使种子吸足水分。浸种时间应充分，但也并非越长越好。浸种时间过长会使种子内部的可溶物外渗，养分流失，甚至种子在水中萌芽，因水中氧气不足而引发无氧呼吸，消耗养分过多过快，并产生大量乙醇，种芽中毒而不利于培育壮苗。浸种时头两天换水一次，以后每天换水一次，保持浸种水的清新，有充足的氧气溶入。